ensembl-hive  2.8.1
Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor Member List

This is the complete list of members for Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor, including all inherited members.

_bind_param_generic_fetch()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
_build_circular_slice_cache()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
_build_exception_cache()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
_build_id_cache()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
_can_straight_join()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
_columns()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
_create_chromosome_alias()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
_default_where_clause()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
_fetch_by_fuzzy_matching()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
_fetch_by_seq_region_synonym()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
_filter_Slice_projections()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
_final_clause()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
_generate_sql()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
_id_cache()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
_left_join()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
_list_dbIDs()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
_logic_name_to_constraint()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
_no_id_cache()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
_objs_from_sth()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
_straight_join()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
_tables()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
_uncached_fetch_all_by_dbID_list()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
_uncached_fetch_all_by_id_list()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
_uncached_fetch_by_dbID()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
bind_param_generic_fetch()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
cache_toplevel_seq_mappings()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
db()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
dbc()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
fetch_all()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
fetch_all_by_dbID_list()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
fetch_all_by_genome_component()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
fetch_all_karyotype()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
fetch_assembly()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
fetch_by_chr_band()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
fetch_by_dbID()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
fetch_by_exon_stable_id()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
fetch_by_Feature()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
fetch_by_gene_stable_id()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
fetch_by_location()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
fetch_by_misc_feature_attribute()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
fetch_by_misc_feature_set()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
fetch_by_name()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
fetch_by_region()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
fetch_by_region_unique()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
fetch_by_seq_region_id()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
fetch_by_toplevel_location()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
fetch_by_transcript_id()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
fetch_by_transcript_stable_id()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
fetch_normalized_slice_projection()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
generate_in_constraint()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
generic_count()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
generic_fetch()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
get_genome_component_for_slice()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
get_karyotype_rank()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
get_seq_region_id()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
has_karyotype()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
ignore_cache_override()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
insert_ignore_clause()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
is_circular()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
is_multispecies()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
is_reference()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
is_toplevel()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
last_insert_id()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
new()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
parse_location_to_values()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
prepare()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
remove()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
remove_assembly()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
schema_version()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
species_id()Bio::EnsEMBL::DBSQL::BaseAdaptor
store()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
store_assembly()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor
update()Bio::EnsEMBL::DBSQL::SliceAdaptor